MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002944	CGG	2	6	240414	240419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
6002	NC_002944	GCT	2	6	240421	240426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406324
6003	NC_002944	GGT	2	6	240448	240453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406324
6004	NC_002944	CGA	2	6	240522	240527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406324
6005	NC_002944	CCG	2	6	240529	240534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
6006	NC_002944	CCG	2	6	240561	240566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
6007	NC_002944	GGC	2	6	240616	240621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
6008	NC_002944	GCG	2	6	240626	240631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
6009	NC_002944	CGC	2	6	240700	240705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
6010	NC_002944	CTA	2	6	240727	240732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406324
6011	NC_002944	CGC	2	6	240751	240756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
6012	NC_002944	CAC	2	6	240778	240783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406324
6013	NC_002944	AGG	2	6	240789	240794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406324
6014	NC_002944	GC	3	6	240808	240813	0 %	0 %	50 %	50 %	41406324
6015	NC_002944	CAC	2	6	240919	240924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406325
6016	NC_002944	GAT	2	6	240979	240984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406325
6017	NC_002944	GGT	2	6	240997	241002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406325
6018	NC_002944	GCCGG	2	10	241003	241012	0 %	0 %	60 %	40 %	41406325
6019	NC_002944	GCCG	2	8	241099	241106	0 %	0 %	50 %	50 %	41406325
6020	NC_002944	ACG	2	6	241107	241112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406325
6021	NC_002944	TTC	2	6	241120	241125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406325
6022	NC_002944	CCA	2	6	241167	241172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406325
6023	NC_002944	GAC	2	6	241210	241215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406325
6024	NC_002944	AGT	2	6	241290	241295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406325
6025	NC_002944	ACG	2	6	241304	241309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406325
6026	NC_002944	GTG	2	6	241310	241315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406325
6027	NC_002944	CGG	2	6	241326	241331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406325
6028	NC_002944	GGA	2	6	241362	241367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406325
6029	NC_002944	GGC	2	6	241381	241386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406325
6030	NC_002944	ACC	2	6	241593	241598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
6031	NC_002944	GCA	3	9	241728	241736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6032	NC_002944	CAG	2	6	241750	241755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6033	NC_002944	TCC	2	6	241772	241777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406326
6034	NC_002944	GGTGTC	2	12	241780	241791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	41406326
6035	NC_002944	TCT	2	6	241794	241799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406326
6036	NC_002944	GCA	2	6	241857	241862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6037	NC_002944	GCT	2	6	241866	241871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6038	NC_002944	AGCG	2	8	241940	241947	25 %	0 %	50 %	25 %	41406326
6039	NC_002944	CGG	2	6	241963	241968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
6040	NC_002944	TCC	2	6	241985	241990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406326
6041	NC_002944	CCA	2	6	242013	242018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
6042	NC_002944	GCT	2	6	242085	242090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6043	NC_002944	GCCG	2	8	242115	242122	0 %	0 %	50 %	50 %	41406326
6044	NC_002944	CCG	2	6	242138	242143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6045	NC_002944	CAC	2	6	242167	242172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
6046	NC_002944	GTG	3	9	242188	242196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
6047	NC_002944	CGG	3	9	242223	242231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
6048	NC_002944	CAC	3	9	242233	242241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
6049	NC_002944	CTG	2	6	242299	242304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6050	NC_002944	GGT	2	6	242314	242319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
6051	NC_002944	GCG	2	6	242345	242350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
6052	NC_002944	GC	3	6	242394	242399	0 %	0 %	50 %	50 %	41406326
6053	NC_002944	GT	3	6	242474	242479	0 %	50 %	50 %	0 %	41406326
6054	NC_002944	TGC	2	6	242513	242518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6055	NC_002944	CGC	2	6	242547	242552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6056	NC_002944	GCG	2	6	242556	242561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
6057	NC_002944	CGA	2	6	242589	242594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6058	NC_002944	CGT	2	6	242598	242603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6059	NC_002944	GCC	2	6	242617	242622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6060	NC_002944	CCA	2	6	242685	242690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
6061	NC_002944	GCCG	2	8	242719	242726	0 %	0 %	50 %	50 %	41406326
6062	NC_002944	GCCG	2	8	242763	242770	0 %	0 %	50 %	50 %	41406326
6063	NC_002944	CGA	2	6	242823	242828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6064	NC_002944	CCG	2	6	242861	242866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6065	NC_002944	ACC	2	6	242913	242918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
6066	NC_002944	TGG	3	9	242925	242933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
6067	NC_002944	CAT	2	6	242947	242952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406326
6068	NC_002944	CAG	2	6	242956	242961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6069	NC_002944	GCA	2	6	242997	243002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6070	NC_002944	CCG	2	6	243003	243008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6071	NC_002944	GGT	2	6	243022	243027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
6072	NC_002944	CGC	2	6	243040	243045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6073	NC_002944	GTG	2	6	243070	243075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
6074	NC_002944	TGG	2	6	243084	243089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
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6078	NC_002944	GTA	3	9	243274	243282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
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6080	NC_002944	TGG	2	6	243336	243341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
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6088	NC_002944	TGA	2	6	243546	243551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
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6092	NC_002944	GGC	2	6	243718	243723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
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6094	NC_002944	GCA	2	6	243744	243749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
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6105	NC_002944	CGC	2	6	244138	244143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
6106	NC_002944	GTG	2	6	244163	244168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
6107	NC_002944	GGCC	2	8	244203	244210	0 %	0 %	50 %	50 %	41406326
6108	NC_002944	CGA	2	6	244242	244247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
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6111	NC_002944	CGA	2	6	244314	244319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
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6113	NC_002944	CGGT	2	8	244418	244425	0 %	25 %	50 %	25 %	41406326
6114	NC_002944	CGA	3	9	244449	244457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
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6117	NC_002944	GGC	2	6	244523	244528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
6118	NC_002944	CGA	2	6	244540	244545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6119	NC_002944	GCGGT	2	10	244590	244599	0 %	20 %	60 %	20 %	41406326
6120	NC_002944	GGT	2	6	244642	244647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
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6122	NC_002944	GCA	2	6	244659	244664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
6123	NC_002944	CGAC	2	8	244674	244681	25 %	0 %	25 %	50 %	41406326
6124	NC_002944	CGC	2	6	244737	244742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
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6128	NC_002944	CGC	2	6	244898	244903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406327
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6241	NC_002944	GCC	2	6	248619	248624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406328
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6488	NC_002944	GTA	2	6	257135	257140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406333
6489	NC_002944	CTT	2	6	257249	257254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406333
6490	NC_002944	CGGCC	2	10	257296	257305	0 %	0 %	40 %	60 %	41406333
6491	NC_002944	GCG	2	6	257314	257319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406333
6492	NC_002944	TCG	2	6	257394	257399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406333
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